病院薬剤師の年収は本当に低い？最新データで見る平均年収・年齢別・開設主体別の実態と転職で年収アップする具体策を徹底解説

病院薬剤師の平均年収は約569万円で、調剤薬局やドラッグストアと比較すると低めですが、国公立病院なら600万円超、生涯年収では薬局薬剤師との差はわずか約500万円に縮まります。本記事では最新の公的データをもとに、年齢別・開設主体別の年収実態から、転職で年収アップを実現する具体的な方法まで徹底解説します。

結論：病院薬剤師の年収相場と転職で年収アップは可能か

結論から言うと、病院薬剤師の年収は「勤務先の選び方」と「キャリア戦略」次第で大きく変わります。厚生労働省「第24回医療経済実態調査（令和5年）」によると、一般病院に勤務する薬剤師の平均年収は568万8,862円です。ただし、国立病院なら約627万円、個人立病院では約657万円と、開設主体によって100万円以上の差が生じます。さらに2026年度診療報酬改定では「ベースアップ評価料」の大幅増点や賃上げ未実施病院への減算規定が導入され、病院薬剤師の年収環境は今まさに改善に向かっています。

年収を上げたい方にとっては、病院に残りつつ専門資格を取得して年収アップを目指す道と、調剤薬局やドラッグストアへ転職して即座に年収を上げる道の2つの選択肢があります。どちらの戦略が最適かは、あなたの年代・ライフプラン・キャリアビジョンによって異なります。

病院薬剤師の基本情報と年収の全体像

病院薬剤師の年収を深掘り解説｜平均・年齢別・手取り額まで

最新データで見る病院薬剤師の平均年収

厚生労働省が発表した「第24回医療経済実態調査（令和5年）」によると、一般病院に勤務する薬剤師の平均年収は568万8,862円です。内訳を見ると、平均給与年度額が456万1,694円、賞与が112万7,167円となっており、賞与は平均給与年度額の約25％に相当します。つまり、病院薬剤師の賞与はおよそ3カ月分の支給です。

一方、2025年に公開された令和6年賃金構造基本統計調査では、薬剤師全体の平均年収が599万3,200円（平均年齢40.9歳）と報告されています。病院薬剤師の年収は薬剤師全体の平均をやや下回るものの、一般労働者の平均年収（約418万円）と比較すれば十分に高い水準です。

また、過去数年の推移を見ると、令和2年度の550万円を底に上昇傾向が続いており、直近の569万円は平成27年度の566万円を上回る水準まで回復しています。

年齢別で見る病院薬剤師の年収推移

厚生労働省のデータに基づく年齢別の病院薬剤師の平均年収は以下の通りです。

20代の病院薬剤師は初任給の低さが響き約380万円にとどまりますが、30代で500万円台に乗り、40代で600万円台、50代では700万円台まで到達します。薬剤師全体の年齢別データと比較すると、20代の段階では病院勤務が最も低い水準ですが、国公立病院の場合は定期昇給の仕組みにより、30代以降で急速に差が縮まる傾向があります。

男女別では、50代男性で784万円、女性で677万円と107万円の開きがありますが、これは出産・育児による勤務形態の変化が影響しており、常勤を継続した場合の男女差はほぼありません。

手取り額のリアルなシミュレーション

年収569万円の場合、社会保険料（健康保険・厚生年金など）と税金（所得税・住民税）を差し引くと、手取り年収はおよそ427万〜455万円、月額にすると35万〜38万円程度です。独身か扶養家族がいるかによって控除額は変動しますが、病院薬剤師として手取り35万円前後が一つの目安になります。

夜勤・当直がある場合は手当が上乗せされるため、当直月4回程度であれば手取りが月2万〜3万円増える計算になります。ただし、身体的・精神的な負担とのバランスは慎重に考える必要があります。

国公立病院vs民間病院｜開設主体で年収はこんなに違う

開設主体別の平均年収データ

病院薬剤師の年収は、病院を運営する「開設主体」によって大きく異なります。第24回医療経済実態調査に基づく最新データは以下の通りです。

国立病院と医療法人の差は約98万円と非常に大きく、同じ「病院薬剤師」でもどこで働くかで年収が大きく変わることがわかります。

国公立病院の給与体系｜安定と昇給が最大の強み

国立病院や公立病院では、公務員またはそれに準じた給与体系が適用されます。国立病院機構の場合、6年制大学卒の基本給は約22万2,700円と規定されており、これに住居手当（最大月27,000円）、通勤手当（最大月55,000円）、地域手当（大阪市なら基本給の16%）などが加算されます。賞与は「年間基本給の約4.2カ月分」が安定的に支給され、毎年月額6,000〜7,000円程度の定期昇給が確約されています。

公務員薬剤師の最大のメリットは、病院の経営状態に左右されない安定した収入と、退職金制度の充実です。初任給は民間より低いものの、30代以降は着実に逆転していくキャリアパスを描けます。

民間病院の給与体系｜スキル次第でチャンスもリスクも

日本の病院の大多数を占める医療法人では、給与体系が法人ごとにまったく異なります。求人票に「年収430万〜620万円」と大きな幅で提示されるケースも珍しくなく、経験やスキルによって条件が大きく変動します。賞与も「業績連動型」や「年俸制で賞与なし」など多様で、定期昇給の保証がない病院も存在します。

一方で、薬剤師が不足している地方の民間病院では、人材確保のために都市部より高い年収を提示するケースもあります。地域選択に柔軟性があれば、民間病院で高年収を得ることも十分に可能です。

病院薬剤師の年収は本当に低い？他の勤務先との徹底比較

勤務先別の年収比較

短期的な年収だけを比較すると、病院薬剤師はたしかに他の勤務先より低い傾向にあります。特に初任給の段階では、病院薬剤師の平均372万7,000円に対して薬局薬剤師は415万3,000円と、約40万円以上の差があります。

生涯年収で見ると差はわずか｜長期視点のキャリア判断が重要

しかし、65歳まで常勤で勤務した場合の生涯年収（中央値）を比較すると、病院薬剤師は約2億3,280万円、薬局薬剤師は約2億3,792万円で、その差はわずか512万円です。40年以上のキャリアで割ると、1年あたり約12万円、月あたり約1万円の差に過ぎません。

これは国公立病院における安定した定期昇給と手厚い退職金制度が、キャリア全体で見た場合に大きく寄与しているためです。「キャリア初期の収入を重視するなら薬局・ドラッグストア」「長期的な安定と専門性の向上を重視するなら病院」という判断軸が見えてきます。

病院薬剤師の年収が低いと感じられる理由

生涯年収では大差がないにもかかわらず、病院薬剤師が「年収が低い」と感じやすいのには明確な理由があります。まず、チーム医療への参加、夜勤・当直、救急対応といった業務の責任と負荷の重さに対して、給与が見合っていないという不満があります。さらに、同期で調剤薬局に就職した薬剤師との初任給の差が、20代〜30代前半の「お金が必要な時期」に直撃するため、体感的な不満が増幅されやすい構造があるのです。

SNS上でも「病院→ドラッグストアに転職して年収160万円アップした」「病院→病院の横移動で年収200万円UPした」といった転職成功談が注目を集めており、年収への問題意識を持つ病院薬剤師は少なくありません。

役職別に見る病院薬剤師の年収｜薬剤部長で700万円超も

主任薬剤師の年収

薬剤主任の年収は400万〜500万円が相場です。業務内容は一般の病院薬剤師と大きく変わらず、経験年数10年未満でも就任できるポジションのため、年収の上昇幅はそれほど大きくありません。ただし、主任薬剤師への昇進は、その後のキャリアアップへの第一歩となります。

薬剤部長の年収

薬剤部長は病院の薬剤部門を統括する最上位職であり、年収は600万〜700万円に達します。調剤業務だけでなく、医薬品の価格調整、ジェネリック医薬品の導入決定、薬剤師スタッフの管理など多岐にわたる業務を担当します。大規模な急性期病院の薬剤部長であれば700万円を超えるケースもあり、経験年数20年〜30年以上のベテランが就任するのが一般的です。

管理薬剤師のポジション

病院の管理薬剤師は平均年収約730万円と、薬剤部長をも上回るデータがあります。ただし、管理薬剤師のポスト自体が限られているため、この水準に到達できる薬剤師はごく一部です。昇進ポストの少なさは病院薬剤師のデメリットの一つであり、年収アップを目指すなら事前に役職ポストの数や昇給規定を確認しておくことが重要です。

口コミ・評判から見える病院薬剤師の年収のリアル

ポジティブな声｜転職で大幅年収アップの実例

SNSや転職体験談では、病院から他の職場への転職で年収が大きくアップした事例が数多く報告されています。ある30代薬剤師の方は、虎ノ門病院からドラッグストアに転職して年収が160万円アップし「生活レベルが変わった」と語っています。また、国公立病院から条件の良い病院への「病院→病院」の横移動で年収200万円アップを実現した事例もあり、「病院に残りたいが年収も上げたい」という層から大きな反響を得ていました。

ネガティブな声｜業界構造への不満

一方で、「薬剤師全体の年収が将来的に下がるのでは」という懸念の声も根強くあります。2026年2月のX（旧Twitter）の投稿では「薬剤師平均年収が550万円から500万円になるかも」という危機感が共有されており、病院薬剤師にとってさらに厳しくなる未来を心配する声が見受けられます。

また「病院薬剤師の給与をアップすればいいだけの話なのに」という、待遇改善への率直な期待を込めた投稿や、「X（旧Twitter）上の薬剤師は年収700万以上稼いでいそうなのに、実際の求人は500万円程度」というリアルと理想のギャップを指摘するユーモラスな声もありました。

Q&Aサイトに寄せられるリアルな疑問

Yahoo!知恵袋や転職相談掲示板では、「奨学金返済を抱えた状態で病院薬剤師の初任給でやっていけるか」「30代で病院から調剤薬局に転職すると年収はいくら上がるのか」「夜勤手当を考慮しても病院薬剤師は割に合うのか」といった切実な質問が多く投稿されています。これらの声からも、病院薬剤師が年収に対して強い関心と不安を抱えていることが見て取れます。

こんな人におすすめ｜病院薬剤師のキャリアが向いている人

病院薬剤師としてのキャリアは、以下のような方に特に向いています。まず、チーム医療の一員として医師や看護師と連携しながら患者さんの治療に深く関わりたい方です。がん薬物療法認定薬剤師や感染制御専門薬剤師、緩和薬物療法認定薬剤師など、高度な専門資格を取得してスペシャリストを目指したい方にとっても、病院は最適な環境です。

また、国公立病院であれば公務員薬剤師として安定した定期昇給と手厚い退職金が保証されるため、長期的な安定を重視する方にも適しています。在宅医療や救急医療など幅広い分野の経験を積みたい方、将来的に薬剤部長などの管理職を目指したい方にも、病院薬剤師のキャリアは大きな可能性を持っています。

逆に、キャリア初期から高い年収を求める方や、副業・兼業で収入を増やしたい方は、調剤薬局やドラッグストアの方が条件を満たしやすいでしょう。転職で年収が下がることが心配な方は、薬剤師が転職で年収が下がる7つの理由｜年収ダウンを防ぐ交渉術と後悔しない判断基準を徹底解説も参考にしてみてください。

病院薬剤師が年収を上げる6つの具体策

方法1：専門資格を取得して希少価値を高める

認定薬剤師や専門薬剤師の資格を持つことで、資格手当の支給に加え、転職時の市場価値が大きく向上します。資格手当を支給している病院は多く、複数の専門資格を保有していればさらに需要が高まります。具体的には、がん薬物療法認定薬剤師、感染制御専門薬剤師、緩和薬物療法認定薬剤師、救急認定薬剤師、在宅療養支援認定薬剤師などが有力な選択肢です。

方法2：国公立病院への転職を目指す

前述の通り、国立病院の平均年収は約627万円で、定期昇給と安定した賞与が魅力です。ただし、公務員試験の年齢制限があるため（国家公務員なら30歳まで、地方公務員は自治体により30代前半まで）、早めの準備が必要です。中途採用の募集は限られているため、20代のうちに検討することをおすすめします。

方法3：地方の病院への転職で年収アップ

薬剤師の年収は地域差が大きく、たとえば東京都の薬剤師平均年収が約536万円であるのに対し、地方では700万円を超える地域もあります。薬剤師不足が深刻な僻地の民間病院では、人材確保のために高待遇で募集しているケースがあり、勤務地にこだわりがなければ転職で年収を大幅に引き上げることが可能です。

方法4：病院内でキャリアアップして管理職を目指す

薬剤主任から薬剤部長へと昇進すれば、年収は600万〜700万円以上に到達します。昇進を目指すためには、日常業務での成果に加え、チーム医療への積極的な参画、病棟薬剤業務の質向上、後輩の指導などが評価ポイントとなります。ただし、昇進ポストが少ないのが実情です。

方法5：調剤薬局・ドラッグストアへの転職

即座に年収を上げたい場合は、調剤薬局やドラッグストアへの転職が最も確実な方法です。病院薬剤師としての臨床経験は調剤薬局でも高く評価され、管理薬剤師や薬局長として採用されるケースも少なくありません。ドラッグストアでは店長やエリアマネージャーなどのポジションで年収700万円以上も視野に入ります。高待遇を目指す方は、薬剤師の転職で高待遇を実現するには？年収アップの5ルートと落とし穴を徹底解説もあわせてご覧ください。

方法6：副業・兼業で収入を補完する

民間病院の場合、就業規則で副業が認められていれば、休日の薬局パートや派遣薬剤師として収入を補完できます。派遣薬剤師の時給は3,000円〜5,000円と高く、月に数日勤務するだけでも年収ベースで数十万円のプラスが見込めます。ただし、国公立病院の公務員薬剤師は原則として副業が禁止されているため注意が必要です。

2026年度診療報酬改定が病院薬剤師の年収に与える追い風

2026年度の診療報酬改定は、病院薬剤師の年収環境にとって大きな追い風です。最も注目すべきポイントは、「ベースアップ評価料」の大幅な増点です。外来ベースアップ評価料は初診時で従来の6点から17点（約3倍）に引き上げられ、継続的に賃上げを実施する病院にはさらに高い点数が設定されています。令和9年6月以降は所定点数の2倍に跳ね上がる仕組みが導入されており、病院薬剤師の基本給底上げの原資が公的に確保されました。

さらに画期的なのは、賃上げ未実施の病院に対する入院基本料の減算規定の新設です。急性期一般入院料1であれば1日121点（1,210円）、特定機能病院であれば141点（1,410円）がすべての入院患者に対して差し引かれます。これにより、病院経営層にとって薬剤師を含む職員の賃上げは「努力義務」ではなく「経営上の必須要件」になったといえます。

病棟薬剤業務の評価も三段階に再編され、新設された病棟薬剤業務実施加算1は300点（従来の120点から2.5倍）に引き上げられました。薬剤総合評価調整加算も100点から160点に増点されており、薬剤師が専門性を発揮するほど病院の収益向上に直結する構造が整えられています。薬剤師の最新の転職動向については、薬剤師転職の最新動向2026｜求人倍率・年収相場・おすすめサイトを徹底解説で詳しく解説しています。

病院薬剤師で年収1000万円は達成できるか

結論から述べると、病院薬剤師の雇用収入だけで年収1000万円に到達するのは非常に難しいのが実情です。厚生労働省の調査では、薬局・医療機関に勤務する薬剤師のうち年収1000万円以上の割合はわずか約2％（1,928人中39人）とされています。

ただし、大学病院や特定機能病院の薬剤部長クラス、あるいは薬剤師不足が深刻な地方の中核病院の管理職であれば、年収800万〜1000万円に手が届くケースもゼロではありません。それでも確実に年収1000万円を目指すなら、製薬企業のMR職への転職、薬局の独立開業、複数のドラッグストアでの管理薬剤師兼務といった選択肢の方が現実的です。

関連記事｜薬剤師の転職に役立つ情報

病院薬剤師の転職や年収に関連する情報は、以下の記事でも詳しく解説しています。

病院薬剤師として転職を検討中の方は、病院薬剤師の転職を成功させる完全ガイド｜年収・仕事内容・失敗しない転職先の選び方を徹底解説【2026年最新】が参考になります。転職先の選び方から面接対策まで網羅的にカバーしています。

残業の少ない職場を探している方には、薬剤師の「残業なし」転職は可能？職場別の実態と年収を下げない戦略を徹底解説がおすすめです。ワークライフバランスを保ちながら年収をキープする方法を解説しています。

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よくある質問（FAQ）

Q1. 病院薬剤師の平均年収はいくらですか？

厚生労働省「第24回医療経済実態調査（令和5年）」によると、一般病院に勤務する薬剤師の平均年収は568万8,862円です。ただし、国立病院では約627万円、医療法人（民間病院）では約529万円と、開設主体によって100万円近い差があります。

Q2. 病院薬剤師の年収は他の薬剤師と比べて低いですか？

短期的な年収で比較すると、調剤薬局やドラッグストアよりも低い傾向にあります。初任給の段階では薬局薬剤師より約40万円低いのが実情です。ただし、生涯年収（65歳まで常勤勤務した場合の中央値）で比較すると、病院薬剤師約2億3,280万円、薬局薬剤師約2億3,792万円と、その差はわずか512万円にとどまります。

Q3. 病院薬剤師が年収を上げるにはどうすればいいですか？

主な方法としては、がん薬物療法認定薬剤師や専門薬剤師などの専門資格の取得、国公立病院への転職、薬剤師不足の地方病院への転職、薬剤部長などの管理職への昇進、調剤薬局やドラッグストアへの転職、副業・兼業の活用の6つがあります。年代やライフプランに合わせた戦略選択が重要です。

Q4. 病院薬剤師で年収1000万円は可能ですか？

病院勤務の雇用収入のみで年収1000万円に到達するのは非常に難しく、薬局・医療機関勤務の薬剤師のうち年収1000万円以上の割合は約2％です。ただし、大学病院や特定機能病院の薬剤部長クラスであれば800万〜1000万円に手が届くケースもあります。確実に1000万円を目指すなら、製薬企業への転職や薬局の独立開業が現実的な選択肢です。

Q5. 2026年度の診療報酬改定で病院薬剤師の年収は上がりますか？

はい、上昇が期待されます。「ベースアップ評価料」の大幅増点により薬剤師の賃上げ原資が公的に確保されたほか、賃上げ未実施の病院には入院基本料の減算ペナルティが新設されました。これにより、病院薬剤師の給与改善は事実上の義務化に近い状況となっています。

Q6. 国公立病院と民間病院、どちらが年収面で有利ですか？

短期的には初任給が高めの民間病院が有利に見えますが、30代以降は定期昇給が確実な国公立病院が逆転するケースが多いです。退職金制度も国公立の方が手厚い傾向があり、生涯年収では国公立病院が有利になることが一般的です。ただし、薬剤師不足の地方民間病院では高待遇で募集するケースもあるため、一概には言えません。

Q7. 病院薬剤師の年収は今後どうなりますか？

2026年度診療報酬改定により、病院薬剤師の専門的業務に対する評価が大幅に引き上げられました。病棟薬剤業務実施加算の上位区分新設（300点）や、心不全再入院予防管理料における薬剤師配置の要件化など、「薬剤師がいないと算定できない」項目が増加しており、病院経営における薬剤師の価値は確実に高まっています。この流れは今後も続くと見られ、年収の改善傾向が持続する可能性は高いといえます。

まとめ｜病院薬剤師の年収アップは戦略次第で実現できる

病院薬剤師の平均年収は約569万円で、調剤薬局やドラッグストアと比較すると低めではありますが、国公立病院では600万円を超え、生涯年収では薬局薬剤師との差はわずか約500万円に過ぎません。さらに2026年度の診療報酬改定により、ベースアップ評価料の増点や賃上げ未実施病院への減算規定が導入され、年収環境は改善に向かっています。

年収アップの鍵は、専門資格の取得、国公立病院や地方病院への転職、管理職への昇進、あるいは調剤薬局・ドラッグストアへのキャリアチェンジといった「自分に合った戦略」を選ぶことです。どの道を選ぶにしても、最新の年収データと市場動向を把握したうえで行動することが、転職成功の第一歩になります。

薬剤師としてのキャリアに悩んでいる方は、まずは転職エージェントに相談して、自分の市場価値を客観的に把握してみることをおすすめします。

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