薬剤師が調剤薬局へ転職すると年収はいくら？平均年収・年代別データから年収アップの具体策まで徹底解説【2026年最新】

調剤薬局で働く薬剤師の平均年収は約450万〜583万円、管理薬剤師なら約500万〜817万円と幅があります。本記事では、2025年公開の政府統計データをもとに、年代別・地域別・企業規模別の年収実態を網羅的に解説し、転職で年収を上げる具体的な方法まで徹底的にお伝えします。

調剤薬局薬剤師の年収 基本データ一覧

調剤薬局で働く薬剤師の平均年収はいくら？最新データで徹底解説

調剤薬局は薬剤師の就業先として最も多く、全薬剤師の約6割が調剤薬局で働いているとされています。では、その年収水準はどの程度なのでしょうか。2025年公開の「令和6年賃金構造基本統計調査」によると、薬剤師全体の平均年収は599.3万円で、前年の577.9万円から21.4万円増加しました。

一方、調剤薬局に限定した場合の年収は、マイナビ薬剤師の独自調査で583.8万円（ドラッグストア調剤部門含む）、ジョブメドレーの1万人調査では正職員で492.7万円となっており、調査方法によって幅があります。保険薬局に勤務する薬剤師の年収を医療経済実態調査ベースで見ると約480万円という報告もあります。この差は、管理薬剤師の含有率、勤務地域、企業規模によるものです。

過去5年間の推移を見ると、2020年調査の565.1万円を底に回復基調が続いています。特に2024年調査では599.3万円と大幅に上昇しており、全産業で進む賃上げの流れが薬剤師の給与にも波及していることがわかります。

【年代別】薬剤師の年収を徹底比較｜20代から50代まで

薬剤師の年収は年齢とともに上昇する傾向にありますが、年代ごとの伸び幅には特徴があります。令和6年賃金構造基本統計調査のデータをもとに、各年代の年収水準を確認していきましょう。

20代薬剤師の年収｜新卒から500万円台への急成長期

20〜24歳の平均年収は399.9万円ですが、25〜29歳になると501.0万円へと一気に100万円以上上昇します。新卒で調剤薬局に入社した場合の初任給は月額25万〜30万円程度が一般的で、年収換算では400万円前後からのスタートです。調剤スキルの習熟とともに昇給し、20代後半には500万円台に乗るケースが多くなっています。

30代薬剤師の年収｜キャリアの分岐点

30〜34歳で564.4万円、35〜39歳で614.1万円と、30代は着実に年収が伸びる時期です。この年代は管理薬剤師への昇進や転職による年収アップが最も活発に起こるタイミングでもあります。一般薬剤師のまま働き続けるか、管理薬剤師やエリアマネージャーを目指すかで、40代以降の年収に大きな差が開きます。

40代薬剤師の年収｜管理職で600万円超

40〜44歳で646.1万円、45〜49歳で667.3万円と、管理薬剤師として活躍する薬剤師が増える年代です。40代前半の薬剤師の平均年収は約646万円で、管理薬剤師であればさらに上乗せが期待できます。

50代薬剤師の年収｜キャリアのピーク

50〜54歳で744.7万円とピークを迎え、55〜59歳では709.3万円とやや下がります。50代は長年の経験や専門性が評価され、最も高い年収水準に達する時期です。ただし、これは管理薬剤師や役職者を含む平均値であり、一般薬剤師のみの場合はもう少し低くなります。

【業種別】調剤薬局 vs ドラッグストア vs 病院 vs 製薬企業の年収比較

薬剤師が働ける業種は多岐にわたり、それぞれ年収水準が異なります。調剤薬局への転職を検討している方にとっては、他業種との比較も重要な判断材料です。

アポプラス薬剤師の2026年最新データによると、業種別の年収目安は次のようになっています。病院薬剤師は約390万〜500万円と最も低く、調剤薬局は約450万〜550万円で業種全体の中間に位置します。ドラッグストアは約515万〜600万円と調剤薬局をやや上回り、製薬会社など企業薬剤師は約550万〜700万円と最も高い水準です。

ただし、調剤薬局は管理薬剤師になることで年収が大幅に上がるのが特徴です。管理薬剤師の平均年収は646万円で、1店舗経営の薬局では平均817万円にも達します。つまり、調剤薬局は一般薬剤師の年収こそ他業種に劣りますが、管理職になれば製薬企業に匹敵する年収を得ることが可能です。また、ワークライフバランスや残業時間の少なさを重視する方にとっては、調剤薬局は魅力的な選択肢になります。残業なしでの転職を検討されている方は、薬剤師の「残業なし」転職は可能？職場別の実態と年収を下げない戦略を徹底解説もご覧ください。

管理薬剤師になると年収はどれだけ上がる？店舗規模別データ

調剤薬局で年収アップを目指すうえで最も確実なルートが、管理薬剤師への昇進です。「第23回医療経済実態調査」のデータによると、管理薬剤師と一般薬剤師の年収差は平均で約200万円にもなります。

興味深いのは、店舗数が少ない薬局ほど管理薬剤師の年収が高いという傾向です。1店舗の薬局では管理薬剤師の年収が平均817万円であるのに対し、一般薬剤師は481万円で、その差は336万円にもなります。2〜5店舗の薬局では管理薬剤師が729万円、一般薬剤師が423万円。20店舗以上の大手チェーンでは管理薬剤師が542万円、一般薬剤師が392万円と、差が縮まります。

この逆転現象は、小規模薬局では管理薬剤師が経営にも深く関与し、利益が直接年収に反映されやすいためです。一方で大手チェーンでは給与テーブルが明確に決まっており、管理薬剤師手当は月3万〜5万円程度にとどまるケースが多いとされています。管理薬剤師を目指すなら、中小規模の薬局の方が年収面でのメリットが大きいと言えるでしょう。

なお、管理薬剤師には副業が法律で制限されるというデメリットもあります。自分が管理する店舗以外で薬事に関する業務を行うことが禁止されているため、休日診療所でのダブルワークなどはできなくなります。年収アップとのトレードオフを考慮したうえで判断することが大切です。

【都道府県別】薬剤師の年収ランキング｜地方転職で年収700万超も

薬剤師の年収は勤務地域によっても大きく異なります。都市部の方が高いと思われがちですが、薬剤師の場合は逆転現象が起きることが珍しくありません。

2025年公開の令和6年賃金構造基本統計調査によると、薬剤師の年収が最も高いのは熊本県の761.8万円で、全国平均の599.3万円を160万円以上も上回っています。2位は広島県の715.7万円、3位は山口県の687.9万円と、九州・中国地方が上位を占めています。一方で、東京都は609.3万円と全国23位、大阪府は569.8万円で36位にとどまり、首都圏・関西圏の主要都市は必ずしも高年収ではないことがわかります。

この理由は薬剤師の需給バランスにあります。人口あたりの薬剤師数が少ない地域では、人材確保のために高い給与条件を提示する傾向があります。地方の調剤薬局では一人薬剤師として勤務するケースも多く、その場合は管理薬剤師手当も含めて年収700万円以上の求人が出ることも珍しくありません。

年収を優先して転職先を選ぶなら、生活コストが低い地方への転職も有力な選択肢です。家賃や物価を考慮すれば、実質的な手取りは都市部勤務以上になるケースも多くあります。

大手調剤薬局の年収ランキング｜企業選びの重要ポイント

調剤薬局チェーンの年収水準も企業によってかなり差があります。有価証券報告書をもとにした上場企業の平均年収ランキング（2026年最新）では、クオールホールディングス（クオール薬局）が734万円で1位、シップヘルスケアホールディングスが720万円で2位、アインホールディングス（アイン薬局）が677万円で3位、スズケン（ファーコス薬局）が612万円で4位、日本調剤が571万円となっています。

ただし注意が必要なのは、上場企業の平均年収にはホールディングス本社の管理職や経営幹部が含まれており、薬局現場の薬剤師のみの年収とは一致しないという点です。OpenWorkの口コミデータでは、調剤薬局業界で年収が高い企業の1位は日本メディカルシステムで平均551万円となっており、現場薬剤師の実態とはやや異なる数字が出てきます。

企業を選ぶ際は、年収だけでなく昇給率、管理薬剤師手当の額、賞与の回数と金額、福利厚生（住宅手当、退職金制度、研修費用補助など）を総合的に比較することが重要です。

調剤薬局への転職で年収アップした薬剤師のリアルな声

病院から調剤薬局への転職で年収200万円アップ

SNS上で注目を集めたのが、病院薬剤師から調剤薬局への転職で年収200万円アップを果たした薬まる氏の体験談です。残業は月5時間以内に減り、人間関係も大幅に改善されたとのこと。病院薬剤師の年収が全業種中で最も低い水準にあることを考えると、調剤薬局への転職による年収アップ効果は顕著と言えます。

4度の転職で年収550万→700万に到達

公務員から薬局、病院を経て再び薬局に戻り、最終的に年収700万円を実現したコタロ氏のケースも参考になります。転職のたびに自分の市場価値を確認し、条件交渉を重ねた結果として年収が段階的にアップしていったそうです。「調剤薬局が自分に合っていた」という結論も印象的で、年収だけでなく適性を見極めることの大切さが伝わってきます。

地方の調剤薬局で年収700万円の女性薬剤師

給与明細が話題になったケースとして、地方の調剤薬局に勤務する40歳前後の女性薬剤師が年収700万円を得ているという事例もあります。地方では薬剤師不足のため好条件の求人が多く、特に転職入社で即戦力として評価されると高い年収が提示される傾向にあります。

これらの体験談を見ると、調剤薬局への転職で年収アップを実現している薬剤師は少なくないことがわかります。一方で、転職で年収が下がるリスクもゼロではありません。薬剤師が転職で年収が下がる7つの理由｜年収ダウンを防ぐ交渉術と後悔しない判断基準を徹底解説についても事前にチェックしておくことをおすすめします。

調剤薬局への転職で年収を上げる5つの具体策

①管理薬剤師ポストを狙って転職する

前述の通り、管理薬剤師は一般薬剤師より平均200万円ほど年収が高くなります。転職時に「管理薬剤師候補」として応募すれば、入社時から高い年収を提示されるケースも多いです。管理薬剤師の経験がなくても、意欲があれば応募可能な求人は豊富にあります。原則として薬局での5年以上の実務経験と認定薬剤師の資格が推奨されますが、必須ではない職場も少なくありません。

②薬剤師不足エリアの求人を探す

地方や郊外の薬局は薬剤師の確保が難しいため、都市部よりも高い年収を提示する傾向があります。都道府県別ランキングで上位の熊本県（761.8万円）や広島県（715.7万円）など、薬剤師不足が深刻な地域への転職は年収アップの有力な選択肢です。生活コストの低さを考慮すれば、実質的な可処分所得は都市部以上になります。

③認定薬剤師・専門薬剤師の資格を取得する

かかりつけ薬剤師指導料の算定には研修認定薬剤師の資格が必要であり、2026年の調剤報酬改定でもかかりつけ機能が重視される方向です。資格を持っていることで薬局側の収益アップに貢献できるため、給与交渉のカードとして有効です。がん薬物療法認定薬剤師や感染制御認定薬剤師といった専門資格も、在宅医療に力を入れる薬局での評価ポイントになります。

④小規模・中規模薬局に転職する

20店舗以上の大手チェーンの管理薬剤師年収は平均542万円ですが、1店舗経営の薬局では817万円と大きな差があります。小規模薬局では管理薬剤師が経営に直結する役割を担うため、利益が年収に反映されやすい構造です。もちろん経営リスクもありますが、安定経営の薬局を見極めることで高年収を実現できます。

⑤転職エージェントを活用して年収交渉を行う

自分一人で年収交渉を行うのは難しいものですが、薬剤師専門の転職エージェントに依頼すれば、業界相場を踏まえた適正年収の提示や条件交渉を代行してもらえます。非公開求人には年収600万円以上の好条件案件が多く含まれるため、登録するだけでも選択肢が大幅に広がります。

2026年調剤報酬改定が薬剤師の年収に与える影響

2026年度の調剤報酬改定は、薬局経営と薬剤師の年収に少なからず影響を与えます。改定率は調剤分が＋0.08%と微増にとどまる一方で、かかりつけ薬剤師指導料の再構築や調剤基本料の判定基準厳格化（集中率85%の壁）など、構造的な変化が進んでいます。

特に注目すべきは「選別」の流れです。かかりつけ機能や在宅対応、リフィル処方箋への対応など、付加価値の高いサービスを提供できる薬局には手厚い報酬が配分される一方、対物調剤中心の薬局は収益確保が難しくなる構図です。薬剤師個人の観点で見ると、対人業務スキルを持つ薬剤師は今後さらに需要が高まり、年収アップのチャンスが広がると考えられます。

今後の転職市場では、かかりつけ薬剤師の実績がある薬剤師、在宅医療の経験がある薬剤師、服薬フォローアップを積極的に行える薬剤師が高く評価される傾向が強まるでしょう。薬剤師の最新転職市場の動向については、薬剤師転職の最新動向2026｜求人倍率・年収相場・おすすめサイトを徹底解説で詳しく解説しています。

こんな薬剤師におすすめ｜調剤薬局への転職で年収アップを狙うべき人

すべての薬剤師に調剤薬局への転職が最適というわけではありません。以下のような状況に当てはまる方は、特に年収アップが期待できる可能性が高いです。

まず、現在病院薬剤師として勤務していて年収が400万円台の方です。病院薬剤師の平均年収は約474万〜521万円と業種中で最も低く、調剤薬局への転職だけで100万円以上の年収アップを実現した事例が多数報告されています。次に、同じ調剤薬局に長年勤務していて昇給が頭打ちになっている方も、転職によって年収が大きく上がるケースがあります。同業種の経験は高く評価されるため、即戦力として好条件での入社が期待できるからです。

さらに、都市部で勤務しているが年収が全国平均を下回っている方、管理薬剤師を目指しているが現職ではポストに空きがない方、ワークライフバランスを改善しつつ年収も維持・向上させたい方にも、調剤薬局への転職は有力な選択肢となります。

薬剤師転職エージェントを活用するメリット

調剤薬局への転職で年収アップを実現するうえで、転職エージェントの活用は非常に効果的です。薬剤師専門の転職エージェントには、一般公開されていない「非公開求人」が多数あり、年収600万円以上の高待遇案件や管理薬剤師候補の案件はその多くが非公開で扱われています。

エージェントを利用するメリットとしては、まず自分の市場価値を客観的に把握できる点があります。業界に精通したキャリアアドバイザーが、あなたの経験・スキル・希望条件をもとに適正年収を算出してくれます。次に、面倒な年収交渉を代行してもらえる点です。自分では言い出しにくい年収アップの希望も、エージェントを通せばスムーズに交渉できます。さらに、転職先の職場環境や人間関係、離職率などの内部情報も提供してもらえるため、入社後のミスマッチを防ぐことができます。

転職を具体的に考えていない段階でも、キャリア相談だけの利用も可能です。まずは自分の年収が適正水準にあるかどうかを確認するだけでも、今後のキャリア戦略を立てるうえで大いに役立ちます。

関連情報｜もっと薬剤師の転職について知りたい方へ

薬剤師の転職と年収に関する情報は、目的や状況に応じて知っておくべきポイントが変わります。以下の記事もあわせて参考にしてください。

調剤薬局への転職を具体的に検討している方には、調剤薬局への薬剤師転職を成功させる完全ガイド｜年収・仕事内容・失敗しないポイントを徹底解説【2026年最新】が、仕事内容・面接対策・失敗しないポイントまで網羅的に解説しています。転職で年収を上げたい方は、薬剤師の転職で高待遇を実現するには？年収アップの5ルートと落とし穴を徹底解説もチェックしてみてください。逆に年収ダウンを心配している方は、薬剤師が転職で年収が下がる7つの理由｜年収ダウンを防ぐ交渉術と後悔しない判断基準を徹底解説が参考になるはずです。

また、薬剤師の転職に関する書籍や情報もあわせてチェックしておくと、より広い視点でキャリアを考えることができます。Amazonで「薬剤師 転職 調剤薬局 年収」を探す

よくある質問（FAQ）

Q. 調剤薬局の薬剤師の手取りはどれくらいですか？

年収500万円の場合、社会保険料や所得税・住民税を差し引いた手取りはおよそ380万〜400万円程度が目安です。月額にすると約32万〜33万円になります。年収600万円であれば手取りは約450万〜470万円、月額にして約37万〜39万円です。賞与の回数や金額、配偶者控除などの適用状況によっても変わるため、あくまで目安としてお考えください。

Q. 薬剤師の年収で1000万円を超えることはできますか？

不可能ではありませんが、調剤薬局の勤務薬剤師として年収1000万円を超えるのは容易ではありません。マイナビ薬剤師の調査では、年収1000万円以上の薬剤師は全体の約6.1%にとどまっています。実現する方法としては、自ら薬局を開業する、複数店舗のエリアマネージャーに昇進する、薬剤師不足が深刻な地域で管理薬剤師として高い年収条件を交渉するといったルートが考えられます。

Q. 薬剤師のパート・派遣の時給相場はどれくらいですか？

調剤薬局のパート薬剤師の時給は2,000円〜2,500円が一般的な相場で、地域や薬局の規模によっては3,000円を超えることもあります。派遣薬剤師の場合はさらに高く、時給2,800円〜4,000円程度が相場です。年収換算すると、フルタイムのパートで400万〜500万円、派遣で500万〜700万円程度になり、正社員と遜色ない収入を得られる場合もあります。ただし、賞与や退職金、福利厚生が限定的になる点には注意が必要です。

Q. 薬剤師の需要は今後も続きますか？年収は上がりますか？

薬学部が6年制に移行して以降、新卒薬剤師の供給は一時的に絞られましたが、近年は薬学部の新設が続き、将来的に薬剤師が飽和するという懸念も指摘されています。ただし、高齢化の進展に伴う調剤需要の増加、在宅医療の拡大、かかりつけ薬剤師機能の強化などを背景に、対人業務ができる薬剤師の需要は今後も堅調と見られます。2024年調査では平均年収が前年比で21.4万円増加しており、全産業的な賃上げの流れも追い風です。

Q. 男性薬剤師と女性薬剤師で年収に差はありますか？

令和6年賃金構造基本統計調査によると、男性薬剤師の平均年収は651.1万円（平均年齢42.7歳）、女性薬剤師は555.8万円（平均年齢39.3歳）で、約95万円の差があります。これは男女の賃金格差というよりも、女性薬剤師の方がパート勤務比率が高いことや、出産・育児によるキャリアの中断が影響していると考えられます。正社員フルタイム同士で比較した場合、同じ経験年数・役職であれば大きな差はない傾向です。

Q. 転職で年収が下がることはありますか？

あります。特に、ドラッグストアから調剤薬局への転職、都市部から別の都市部への転職、管理薬剤師から一般薬剤師への転職などは年収が下がるケースがあります。また、転職先の薬局の経営状態や昇給体系を事前に確認しないまま転職すると、入社時の年収は高くてもその後の昇給がほとんどないという事態も起こり得ます。こうしたリスクを避けるためにも、転職エージェントを通じた情報収集と条件交渉が重要です。

まとめ｜調剤薬局薬剤師の年収アップは戦略次第で実現できる

調剤薬局で働く薬剤師の年収は、一般薬剤師で約450万〜583万円、管理薬剤師なら646万円から800万円超と幅広い水準にあります。年収アップを実現するための王道は、管理薬剤師への昇進、地方・薬剤師不足エリアへの転職、認定薬剤師資格の取得、そして転職エージェントを活用した年収交渉の4つです。

2026年の調剤報酬改定により、かかりつけ機能や対人業務を重視する薬局にはより手厚い報酬が配分される方向にあります。この流れは、対人業務スキルを磨いてきた薬剤師にとって大きなチャンスです。「今の年収に満足していない」「もっとキャリアアップしたい」と感じている方は、まず自分の市場価値を把握するところから始めてみてはいかがでしょうか。